Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot1Q6ZQ08 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot1Q6ZQ08 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms