Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smpd4Q6ZPR5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms