Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf653Q6YND2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf653Q6YND2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms