Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc44a1Q6X893 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms