Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P4ha3Q6W3F0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P4ha3Q6W3F0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms