Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift172Q6VH22 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift172Q6VH22 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms