Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nudcd1Q6PIP5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudcd1Q6PIP5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms