Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Lrrn2Q6PHP6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn2Q6PHP6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn2Q6PHP6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms