Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc57Q6PHN1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc57Q6PHN1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms