Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pik3c3Q6PF93 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3c3Q6PF93 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms