Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtifQ6PEE2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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