Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfrlQ6PE55 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PdgfrlQ6PE55 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms