Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc85bQ6PDY0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms