Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dtx4Q6PDK8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dtx4Q6PDK8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms