Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SvoplQ6PDF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SvoplQ6PDF3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms