Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbtb40Q6PCS8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbtb40Q6PCS8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms