Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Herc4Q6PAV2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Herc4Q6PAV2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms