Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Usp49Q6P9L4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp49Q6P9L4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp49Q6P9L4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp49Q6P9L4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp49Q6P9L4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp49Q6P9L4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp49Q6P9L4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp49Q6P9L4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp49Q6P9L4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Usp49Q6P9L4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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