Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2aQ6P4T0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms