Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdac10Q6P3E7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdac10Q6P3E7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms