Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BckdhbQ6P3A8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms