Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrimpolQ6P1E7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrimpolQ6P1E7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms