Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Asic1Q6NXK8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms