Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpsf6Q6NVF9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpsf6Q6NVF9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms