Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HelbQ6NVF4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HelbQ6NVF4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms