Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SphkapQ6NSW3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SphkapQ6NSW3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms