Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep78Q6IRU7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cep78Q6IRU7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms