Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ParpbpQ6IRT3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ParpbpQ6IRT3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms