Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Carmil1Q6EDY6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Carmil1Q6EDY6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms