Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop58Q6DFW4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms