Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Jmjd1cQ69ZK6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms