Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CltcQ68FD5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CltcQ68FD5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms