Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlrp4eQ66X19 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms