Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp9cQ66X01 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms