Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp7bQ64446 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp7bQ64446 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms