Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Abcg1Q64343 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Abcg1Q64343 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Abcg1Q64343 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcg1Q64343 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Abcg1Q64343 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Abcg1Q64343 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcg1Q64343 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Abcg1Q64343 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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