Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt12Q64291 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt12Q64291 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms