Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6eQ64253 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms