Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf1Q64213 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms