Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc18Q640L5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc18Q640L5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
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