Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lcn3Q62471 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms