Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vat1Q62465 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vat1Q62465 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms