Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vamp1Q62442 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vamp1Q62442 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms