Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AtmQ62388 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AtmQ62388 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms