Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sprr1bQ62267 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sprr1bQ62267 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms