Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sall3Q62255 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sall3Q62255 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms