Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sycp1Q62209 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms