Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ssr4Q62186 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ssr4Q62186 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ssr4Q62186 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ssr4Q62186 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssr4Q62186 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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