Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprrQ62132 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms