Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phox2aQ62066 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Phox2aQ62066 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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